Несмотря на жесткие меры властей Азербайджана, эта страна продолжает кишеть исламистами. Более того, очевидна их связь с боевиками на Северном Кавказе России. Такой вывод следует из опубликованного доклада Госдепа США о борьбе с терроризмом в мире в 2009 году. В документе детально перечислены имена арестованных лиц, имеющих непосредственную связь с террористической деятельностью.
Так, Министерство национальной безопасности арестовало 15 граждан Азербайджана, которые являются членами группировки «Армии Махди» — экстремистской организации. 18 июня 2009 года Военный суд по тяжким преступлениям приговорил лейтенанта Кямрана Асадова и 20 сообщников к тюремному заключению сроком от двух до 15 лет за участие в неудачном заговоре с целью нападения на американские и британские посольства в Баку в конце 2007 года. Асадов и соучастники украли оружие и боеприпасы из военной базы и совершили вооруженный разбой на АЗС «Лукойл».
4 октября суд Баку приговорил двух граждан Ливана, Мухаммеда Али Караки и Али Хусейна Наджмеддина, к 15 годам каждого, а четырех азербайджанских сообщников к различным срокам от двух до 14 лет. Суд установил, что группа планировала нападение на израильское посольство. Расследование показало, что Караки и Хусейн были связаны с «Хезболлой».
В двух отдельных судебных процессах в октябре Суд по тяжким преступлениям приговорил 15 граждан Азербайджана к тюремному заключению сроком от шести до 30 месяцев за участие в незаконных вооруженных группировках в Пакистане и Афганистане. В 11 случаях, когда обвиняемые получили шесть месяцев наказания, они были освобождены, поскольку с момента их ареста уже прошло столько времени. В зависимости от отдельных сочетаний предъявленных обвинений, каждому из 15 подсудимых угрожала мера наказания до 5 или 7 лет.
4 ноября суд Баку приговорил 26 человек – 23 азербайджанцев, 2 граждан Турции и одного гражданина России – к тюремному заключению сроком от 2 до 15 лет за нападение 17 августа 2008 года на главную суннитскую мечеть Баку, известную как «Абу Бакр». В результате взрыва гранаты погибло три человека и было ранено восемь. Мечеть не открылась после нападения. Правительство Азербайджана связало нападавших на мечеть «Абу Бакр» с организацией «Лесные братья» на Северном Кавказе, лидер которой, Ильгар Моллачиев, был убит в Дагестане в сентябре 2008 года.